قامت جامعة أسوان بالتعاون مع مؤسسات صحية خارجية وهى:-
– مسـتشفى أسيوط الجامعى.
– مسـتشفى عين شمس التخصصى.
– مسـتشفى أسوان الجامعى.
– مسـتشفى أسوان للعيون والليزر.
– مـعامل الـبـرج.
– مـعامل الـمخـتبـر.
– مركز رادار للخـدمـات الطبية ” أشـعة وتحـاليل”
– التعاون مع مديرية الشئون الصحية بأســوان (وزارة الصحة) لتوفير الأمصــال حيث أن موقع الجامعة الجغـرافي يقع فى حديث العهد لذه يتم توفيـر الأمصال اللازمة (العقرب – الثعبان – التيتانوس).
– بالتعاون مع حملة مائة مليــون صحة تم أجـراء تحليل لأكثر من ثلاثة عشر ألف طـالب لفيروس سي وكانت النتيجة وجود خمسة عشرة حالة فقط من الطــلاب مصابة وتم عمل اللازم من تحاليل وصـرف العـلاج اللازم لهم.
– التعـاون من الطب الوقائي لرش المبيدات الحشرية حول المدن الجامعية بالنسبة للطــلاب الذين يعانون من أمـراض نفسية أو عصبية يتم توفير العــلاج اللازم مهم عن طريق مستشفى أســوان الجامعى أو استخراج القيمة المالية للعــلاج بناء على اللائحة الخاصة بالإدارة الطبية والمعتمد من مجلس الجامعة.